武帝上
高祖武皇帝名劉裕，字德輿，小名寄奴，彭城縣綏輿裏人，是漢高帝的弟弟楚元王劉交的後代。劉交生紅懿侯劉富，劉富生宗正辟強，辟強生陽城繆侯劉德，劉德生陽城節侯安民，安民生陽城厘侯慶忌，慶忌生陽城肅侯劉岑，劉岑生宗正劉平，劉平生束武城令某某，某某生束萊太守劉景，劉景生明經劉洽，劉洽生博士劉弘，劉弘生琅邪都尉劉悝，劉悝生曹魏定襄太守呆某，某某生邪城令劉亮，劉亮生西晉北平太守劉膺，劉膺生相國掾劉熙，劉熙生開封令旭孫。旭孫之子劉混，剛渡過長江時，定居在晉陵郡丹徒縣的京口裏，任官至武原令。劉混生東妄太守室嫗，劉擅生郡功曹型塑，他就是達旦查的父親。盲祖在晉哀帝興寧元年年次癸亥的三月壬寅夜出生。等到成人，身高七尺六寸，風度奇特。家貧，有大誌，言行灑脫而不假修飾。侍奉繼母以孝著稱。

高祖武皇帝諱裕，字德輿，小名寄奴，彭城縣綏輿裏人，漢高帝弟楚元王交之後也。交生紅懿侯富，富生宗正辟強，辟強生陽城繆侯德，德生陽城節侯安民，安民生陽城釐侯慶忌，慶忌生陽城肅侯岑，岑生宗正平，平生東武城令某，某生東萊太守景，景生明經洽，洽生博士弘，弘生琅邪都尉悝，悝生魏定襄太守某，某生邪城令亮，亮生晉北平太守膺，膺生相國掾熙，熙生開封令旭孫，旭孫生混，始過江，居晉陵郡丹徒縣之京口裏，官至武原令。混生東安太守靖，靖生郡功曹翹，是為皇考。高祖以晉哀帝興寧元年歲次癸亥三月壬寅夜生。及長，身長七尺六寸，風骨奇特。家貧，有大誌，不治廉隅。事繼母以孝謹稱。
起初擔任冠軍將軍孫無終的司馬。安帝隆塞三年十一月，妖賊孫恩在會稽作亂，晉朝衛將軍趲毖、前將軍劉生之東伐．空之請直擔參謀軍事。十二月，牢之到吳地，而沿途多賊寇，牢之命直擔和幾十個人偵察賊情。突遇幾千賊兵，高擔便同他們交戰。所帶領的人大多死去，而士氣不減，手舞大刀，殺傷很多。牢之之子敬宣怕高擔長久在外，被賊圍困，就率輕裝騎兵尋找他。不久眾多騎兵一起到來，賊寇才退走，殺死賊寇一千多人，乘勝前進，平定山陰，孫恩逃到海上。

初為冠軍孫無終司馬。安帝隆安三年十一月，妖賊孫恩作亂於會稽，晉朝衛將軍謝琰、前將軍劉牢之東討。牢之請高祖參府軍事。十二月，牢之至吳，而賊緣道屯結，牢之命高祖與數十人，覘賊遠近。會遇賊至，眾數千人，高祖便進與戰。所將人多死，而戰意方厲，手奮長刀，所殺傷甚眾。牢之子敬宣疑高祖淹久，恐為賊所困，乃輕騎尋之。既而眾騎並至，賊乃奔退，斬獲千餘人，推鋒而進，平山陰，恩遁還入海。四年五月，恩複入會稽，殺衛將軍謝琰。十一月，劉牢之複率眾東征，恩退走。牢之屯上虞，使高祖戍句章城。句章城既卑小，戰士不盈數百人。高祖常被堅執銳，為士卒先，每戰輒摧鋒陷陣，賊乃退還浹口。於時東伐諸帥，禦軍無律，士卒暴掠，甚為百姓所苦。唯高祖法令明整，所至莫不親賴焉。
四年五月，孫恩又侵犯會稽，殺死衛將軍謝琰。十一月，劉牢之又率領部眾束征，孫恩撤退逃跑。牢之駐守上虞，派高祖戍守句章城。句章城本來就狹小，戰士不過幾百人，高祖經常披堅執銳，身先士卒，每次作戰衝鋒陷陣，賊寇於是退回浹。這時束征各將帶兵無方，士兵搶劫，很為百姓所厭惡。衹有高祖法令嚴明，所到之處無不受到歡迎。

五年春，孫恩頻攻句章，高祖屢摧破之，恩複走入海。三月，恩北出海鹽，高祖追而翼之，築城於海鹽故治。賊日來攻城，城內兵力甚弱，高祖乃選敢死之士數百人，鹹脫甲胄，執短兵，並鼓噪而出。賊震懼奪氣，因其懼而奔之，並棄甲散走，斬其大帥姚盛。雖連戰克勝，然眾寡不敵，高祖獨深慮之。一夜，偃旗匿眾，若已遁者。明晨開門，使羸疾數人登城。賊遙問劉諱所在，曰：“夜已走矣。”賊信之，乃率眾大上。高祖乘其懈怠，奮擊，大破之。恩知城不可下，乃進向滬瀆。高祖複棄城追之。海鹽令鮑陋遣子嗣之以吳兵一千，請為前驅。高祖曰：“賊兵甚精，吳人不習戰。若前驅失利，必敗我軍，可在後為聲援。”不從。是夜，高祖多設伏兵，兼置旗鼓，然一處不過數人。明日，賊率眾萬餘迎戰。前驅既交，諸伏皆出，舉旗鳴鼓。賊謂四麵有軍，乃退。嗣之追奔，為賊所沒。高祖且戰且退，賊盛，所領死傷且盡。高祖慮不免，至向伏兵處，乃止，令左右脫取死人衣。賊謂當走反停，疑猶有伏。高祖因呼更戰，氣色甚猛，賊眾以為然，乃引軍去。高祖徐歸，然後散兵稍集。五月，孫恩破滬瀆，殺吳國內史袁山鬆，死者四千人。是月，高祖複破賊於婁縣。六月，恩乘勝浮海，奄至丹徒，戰士十餘萬。劉牢之猶屯山陰，京邑震動。高祖倍道兼行，與賊俱至。於時眾力既寡，加以步遠疲勞，而丹徒守軍莫有鬥誌。恩率眾數萬，鼓噪登蒜山，居民皆荷擔而立。高祖率所領奔擊，大破之，投巘赴水死者甚眾。恩以彭排自載，僅得還船。雖被摧破，猶恃其眾力，徑向京師。樓船高大，值風不得進，旬日乃至白石。尋知劉牢之已還，朝廷有備，遂走向鬱洲。八月，以高祖為建武將軍、下邳太守，領水軍追恩至鬱洲，複大破恩，恩南走。十一月，高祖追恩於滬瀆，及海鹽，又破之。三戰，並大獲，俘馘以萬數。恩自是饑饉疾疫，死者太半，自浹口奔臨海。
五年春，玨墨頻繁攻打包童，產擔多次打敗他，遜墨又逃入海中．三月，孫恩向北出兵到海鹽，直擔從左右兩翼追擊，在海鹽舊治所築城。賊寇每天來攻城，城內兵力很薄弱，高祖就挑選敢死之士幾百人，脫下鍾甲，拿著短兵器，鼓噪出城，賊寇喪膽，利用他們的畏懼而衝擊，賊寇都丟下鏜甲四散逃跑，殺死他們的大帥姚盛。雖然連戰皆勝，然而寡不敵眾，高祖仍然深感憂慮。一天夜裏，放倒旗幟隱蔽部眾，好似已逃走的樣子。次早晨打開城門，派老弱士兵數人登上城頭。賊寇遠遠地詢問劉裕在哪裹。回答說：“夜晚已經離開了。”賊寇相信了他們的話，就率領部眾大舉登城。晝祖趁賊寇懈怠，奮力出擊，大破賊寇。亟恩知道城池攻不下，就前去滬瀆。直擔又拋下城池追擊。海鹽令鮑陋派遣兒子嗣之率領呈地兵士一千人，請求做前鋒。高祖說：“賊寇兵士很精銳，吳地人不熟悉戰事，如果前鋒失利，我軍必敗。你們可在後方聲援。”嗣之不聽。這天夜晚，直擔設下很多埋伏，添置旌旗戰鼓，然而一處不過幾個人。次日，賊寇率領部眾一萬多人迎戰。前鋒相交之後，各處伏兵齊出，舉起旗幟敲起戰鼓。賊寇以為四麵皆兵。於是退卻。員蛙追擊，被賊寇殺死。高祖邊戰邊退，賊寇強盛，直擔所領兵士差不多死傷光了。壺擔考慮不能幸免，到了埋伏兵馬的地方就停下來，命令左右的人脫取死人的衣服。賊寇以為高擔應該逃跑反而停下來，懷疑還有埋伏。高祖於是呼喊再戰，神色十分威猛，賊寇以為真是如此，就率車離去。高祖慢慢退回，隨後失散的兵士漸漸會集。五月，孫恩攻下滬瀆，殺死吳國內史袁山鬆，死亡的有四千人。這月，高祖又在婁縣打敗賊寇。

元興元年正月，驃騎將軍司馬元顯西伐荊州刺史桓玄，玄亦率荊楚大眾，下討元顯。元顯遣鎮北將軍劉牢之拒之，高祖參其軍事，次溧洲。玄至，高祖請擊之，不許，將遣子敬宣詣玄請和。高祖與牢之甥東海何無忌並固請，不從。遂遣敬宣詣玄，玄克京邑，殺元顯，以牢之為會稽內史。懼而告高祖曰：“便奪我兵，禍其至矣。今當北就高雅於廣陵舉事，卿能從我去乎？”答曰：“將軍以勁卒數萬，望風降服。彼新得誌，威震天下。三軍人情，都已去矣，廣陵豈可得至邪！諱當反複還京口耳。”牢之叛走，自縊死。何無忌謂高祖曰：“我將何之？”高祖曰：“鎮北去必不免，卿可隨我還京口。桓玄必能守節北麵，我當與卿事之。不然，與卿圖之。今方是玄矯情任算之日，必將用我輩也。”桓玄從兄修以撫軍鎮丹徒，以高祖為中兵參軍，軍、郡如故。
六月，孫恩乘勝沿海路，突然到達丹徒，戰士有十多萬人。劉牢之還駐守在山陰，京城震動。高祖夜趕路，和賊寇同時到達。這時兵力弱小，加上長途步行兵士疲勞，而丹徒守衛的軍隊沒有鬥誌。孫恩率領部眾幾萬人，鼓噪而登蒜山，居民都挑著擔子站立。高祖率領部屬飛奔出擊，大敗賊軍，賊軍跳下山峰投入水中而死的人很多。孫恩用盾牌承載自己。勉強得以回到船上。他雖然被打敗，還仗著人多，徑直攻向京城。戰船高大，遇風暴不能前進，十天後才到達直至。不久知道劉生之已返回，朝廷有戒備，就奔向鬱泌。八月，朝廷任命高祖為建武將軍、下邳太守，統領水軍追擊孫恩到鬱洲，又大敗孫墨。遜墨向南逃跑。十一月，高祖追擊孫恩到滬遺，在痙鹽追上，又打敗孫恩。三次交戰都大有收獲，俘虜斬首上萬。孫恩部眾從此因病因餓而死亡大半，從浹口逃往臨海。

孫恩自奔敗之後，徒旅漸散，懼生見獲，乃於臨海投水死。餘眾推恩妹夫盧循為主。桓玄欲且緝寧東土，以循為永嘉太守。循雖受命，而寇暴不已。五月，玄複遣高祖東征。時循自臨海入東陽。二年正月，玄複遣高祖破循於東陽。循奔永嘉，複追破之，斬其大帥張士道，追討至於晉安，循浮海南走。六月，加高祖彭城內史。
五裏元年正月，驃騎將軍司馬元顯向西討伐趔業刺史旦玄，但玄也率領趔楚大軍，向下討伐五邇。互麵派遣鎮北將軍劉牢之抵禦，高祖為空之參謀軍事。駐在速洲。桓玄到達，高祖請求出擊但玄，空之不答應，將要派遣兒子敬宣前往彙那裹講和。越和絲的外甥曲人困都一再勸阻，未被采納。於是派遣敬宣前往桓玄那裹。擔玄攻克京城，殺五顯，任命牢之為會稽內史。爭之畏懼而對產擔說：“他奪了我的兵權，大禍就要臨頭。現在應當向北投奔高雅在廣陵起兵，你能隨我前往嗎?”高祖回答說：“將軍率領幾萬強兵而望風投降。桓玄剛得勢，威震天下。三軍人心，都已散了，廣陵哪裹可能到達呢我當為舊君服喪退回複裏而已。”空之反叛逃走自縊而死。但盤墨對奩擔說：“我該到何處去?”高擔說：“鎮北將軍此去必不能幸免，你可隨我回亙旦。旦玄確能保守節操侍奉君主，我當和你侍奉他；否則，和你一起圖取他。現在正是桓玄矯情用智的時候，必用我們這些人。”桓玄的堂兄桓脩任撫軍將軍鎮守丹徒，委任高祖為中兵參軍，軍職、郡職照舊。

桓玄為楚王，將謀篡盜。玄從兄衛將軍謙屏人問高祖曰：“楚王勳德隆重，四海歸懷。朝廷之情，鹹謂宜有揖讓，卿意以為何如？”高祖既誌欲圖玄，乃遜辭答曰：“楚王，宣武之子，勳德蓋世。晉室微弱，民望久移，乘運禪代，有何不可！”謙喜曰：“卿謂可爾，便當是真可爾。”十二月，桓玄篡帝位，遷天子於尋陽。桓修入朝，高祖從至京邑。玄見高祖，謂司徒王謐曰：“昨見劉諱，風骨不恆，蓋人傑也。”每遊集，輒引接殷勤，贈賜甚厚。高祖愈惡之。或說玄曰：“劉諱龍行虎步，視瞻不凡，恐不為人下，宜蚤為其所。”玄曰：“我方欲平蕩中原，非劉諱莫可付以大事。關隴平定，然後當別議之耳。”玄乃下詔曰：“劉諱以寡製眾，屢摧妖鋒，泛海窮追，十殄其八。諸將力戰，多被重創。自元帥以下至於將士，並宜論賞，以敘勳烈。”
孫恩自從失敗逃亡之後，部眾逐漸離散，怕被活捉，就在臨海投水而死．殘餘的部眾推舉孫恩的妹夫盧循為首領。桓玄想要姑且安寧東部地區，任命盧循為永嘉太守。盧循雖然接受任命，而作亂劫掠不止。五月，桓玄又派遣高祖東征。當時盧循從臨海進入東陽。二年正月，桓玄又派遣高祖在束陽打敗盧循。盧循逃奔永嘉，高祖又追擊打敗他，殺死他的大帥張士道，追擊討伐直到晉安，盧循從海上向南逃走。六月，加授高祖為彭城內史。

先是，高祖東征盧循，何無忌隨至山陰，勸於會稽舉義。高祖以為玄未據極位，且會稽遙遠，事濟為難，俟其篡逆事著，徐於京口圖之，不憂不克。至是桓修還京，高祖托以金創疾動，不堪步從，乃與無忌同船共還，建興複之計。於是與弟道規、沛郡劉毅、平昌孟昶、任城魏詠之、高平檀憑之、琅邪諸葛長民、太原王元德、隴西辛扈興、東莞童厚之，並同義謀。時桓修弟弘為征虜將軍、青州刺史，鎮廣陵。道規為弘中兵參軍，昶為州主簿。乃令毅潛往就昶，聚徒於江北，謀起兵殺弘。長民為豫州刺史刁逵左軍府參軍，謀據曆陽相應。元德、厚之謀於京邑，聚眾攻玄，並克期齊發。
桓玄做楚王，將謀劃篡奪帝位。桓玄的堂兄衛將軍桓謙摒退他人詢問高祖說：“楚王功高德隆，四海信服。朝廷上下都認為應實行禪讓，您以為怎麼樣?”高祖心中既想圖取桓玄，就用恭順的言語回答說：“楚王是宣武王的兒子，功高一世．晉室微弱，民望早已轉移，乘機禪讓，有什麼不可以?”桓謙高興地說：“您認為可以，就是真可以了。”十二月，桓玄篡奪帝位，將天子遷到尋陽。桓脩入朝，高祖隨同到京城。桓玄見到產祖，對司徒王謐說：“昨天見到劉裕，風度不凡，是人中豪傑。”每次遊覽集會，都接待殷勤，贈送賞賜很豐厚。高祖更加厭恨桓玄。有人勸桓玄說：“劉裕龍行虎步，氣概非凡，恐怕不會甘居人下，應該早作打算。”桓玄說：“我正要掃蕩中原，非劉裕不足以托付大事。關中、隴西平定後，然後當另加考慮。”桓玄於是下詔說：“型塋以少數人製服眾多的人，屢次摧敗妖賊的鋒芒。乘船入海窮追猛打，妖賊被殲滅十分之七八。諸將拚命作戰，多受重傷。自主帥以下直到將領士兵，都應評定賞賜，來表彰功勳。”

三年二月己醜朔，乙卯，高祖托以遊獵，與無忌等收集義徒，凡同謀何無忌、魏詠之、詠之弟欣之、順之、檀憑之、憑之從子韶、弟祗、隆與叔道濟、道濟從兄範之、高祖弟道憐、劉毅、毅從弟籓、孟昶、昶族弟懷玉、河內向彌、管義之、陳留周安穆、臨淮劉蔚、從弟珪之、東莞臧熹、從弟寶符、從子穆生、童茂宗、陳郡周道民、漁陽田演、譙國範清等二十七人；願從者百餘人。丙辰，詰旦，城開，無忌服傳詔服，稱詔居前。義眾馳入，齊聲大呼，吏士驚散，莫敢動，即斬修以徇。高祖哭甚慟，厚加殯斂。孟昶勸弘其日出獵。未明開門，出獵人，昶、道規、毅等率壯士五六十人因開門直入。弘方啖粥，即斬之，因收眾濟江。義軍初克京城，修司馬刁弘率文武佐吏來赴。高祖登城謂之曰：“郭江州已奉乘輿反正於尋陽，我等並被密詔，誅除逆黨，同會今日。賊玄之首，已當梟於大航矣。諸君非大晉之臣乎，今來欲何為？”弘等信之，收眾而退。毅既至，高祖命誅弘。
在這之前直擔束征盧循，何想星跟隨他到達山壓，勸說他在盒稽起義。宣擔以為但玄還未占據帝位，而且盒稽離京城遙遠，事情難以成功，等到豔篡位叛逆的事情顯著，慢慢地在塞旦收拾他，不怕不成功。到這時擔愷還京，產擔假稱刀傷發作，不能徒步隨從，就和無忌同船一起回京，訂下複興晉國的計策。於是和弟弟道規、沛郡人劉毅、平昌人孟昶、任城人魏詠之、高平人檀憑之、琅邪人諸葛長民、太原人王元德、隴西人辛扈興、東莞人童厚之一起參與起義。當時桓脩的弟弟桓弘擔任征虜將軍、青州刺史，鎮守廣陵。道規任桓弘的中兵參軍，孟昶任州主簿。於是派劉毅秘密前往會合孟昶，在長江北聚集部眾，計劃起兵殺死桓弘。長民任豫州刺史刁逵的左軍府參軍，謀劃占據曆陽相互響應。元德、厚之謀劃在京城聚集兵馬攻打桓玄，並約定期一齊發動。

毅兄邁先在京師，事未發數日，高祖遣同謀周安穆報之，使為內應。邁外雖酬許，內甚震懼。安穆見其惶駭，慮事必泄，乃馳歸。時玄以邁為竟陵太守，邁不知所為，便下船欲之郡。是夜，玄與邁書曰：“北府人情雲何？卿近見劉諱何所道？”邁謂玄已知其謀，晨起白之。玄驚懼，封邁為重安侯，既而嫌邁不執安穆，使得逃去，乃殺之。誅元德、扈興、厚之等。召桓謙、卞範之等謀拒高祖。謙等曰：“亟遣兵擊之。”玄曰：“不然。彼兵速銳，計出萬死。若行遣水軍，不足相抗；如有蹉跌，則彼氣成而吾事敗矣！不如屯大眾於覆舟山以待之。彼空行二百裏，無所措手，銳氣已挫，既至，忽見大軍，必驚懼駭愕。我案兵堅陣，勿與交鋒。彼求戰不得，自然散走。此計之上也。”謙等固請，乃遣頓丘太守吳甫之、右衛將軍皇甫敷北拒義軍。玄自聞軍起，憂懼無複為計。或曰：“劉諱等眾力甚弱，豈辦之有成，陛下何慮之甚！”玄曰：“劉諱足為一世之雄，劉毅家無擔石之儲，摴蒲一擲百萬；何無忌，劉牢之甥，酷似其舅。共舉大事，何謂無成。”
三年二月己醜初一，乙卯．高祖假托狩獵，和無忌等人聚集起義徒眾，同謀的共有何無忌、魏泳之、詠之的弟弟欣之、順之、檀憑之、憑之的侄兒檀韶、檀韶的弟弟檀祗、檀隆、道濟、道濟的堂兄範之、高祖的弟弟道憐、劉毅、劉毅的堂弟劉藩、孟昶、孟昶的遠房弟弟懷玉、河內人向彌、管義之、陳留人周安穆、臨淮人劉蔚、堂弟珪之、東莞人臧熹、堂弟寶符、侄兒穆牛、童茂宗、陳郡人周道民、漁陽人田演、譙國人範清等二十七人；願意跟從的有一百多人。丙辰，清晨，城門打開，無忌穿著傳達詔令的服裝，念詔命走在前麵。起義的人奔馳進城，齊聲大叫，官吏兵上驚訝逃散，不敢行動，當即斬桓脩示眾。高祖哭得很悲傷，對桓脩厚加收殮。孟昶勸說桓弘當天出城狩獵。天未亮打開城門，放出狩獵的人，孟昶、道規、劉毅等人率領壯士五六十人利用開門時徑直衝入官府。桓弘正在喝粥，當即殺死他，隨之聚集部眾渡過長江。

眾推高祖為盟主，移檄京邑，曰：
起義軍剛攻克京城，桓脩的司馬刁弘率領文武佐吏前來奔赴。高祖登上城頭對他們說：“郭型業已擁戴皇上在尋陽重登帝位，我們都接受秘密的韶書，誅殺叛逆的黨羽，在今同時發動。賊人擔玄的首級，當已在大航示眾了。各位不是太置的臣屬嗎，現在來想做什麼?”刁弘等人相信了這些話，集合部眾退走。劉毅到達後，高祖令他殺刁弘。

夫治亂相因，理不常泰，狡焉肆虐，或值聖明。自我大晉，陽九屢構。隆安以來，難結皇室。忠臣碎於虎口，貞良弊於豺狼。逆臣桓玄，陵虐人鬼，阻兵荊郢，肆暴都邑。天未亡難，凶力繁興，逾年之間，遂傾皇祚。主上播越，流幸非所；神器沉淪，七廟毀墜。夏後之罹浞、豷，有漢之遭莽、卓，方之於玄，未足為喻。自玄篡逆，於今曆年，亢旱彌時，民無生氣。加以士庶疲於轉輸，文武困於造築，父子乖離，室家分散，豈唯《大東》有杼軸之悲，《摽梅》有傾筐之怨而已哉！仰觀天文，俯察人事，此而能久，孰有可亡！凡在有心，誰不扼腕。諱等所以叩心泣血，不遑啟處者也。是故夕寐宵興，援獎忠烈，潛構崎嶇，險過履虎。輔國將軍劉毅、廣武將軍何無忌、鎮北主簿孟昶、兗州主簿魏詠之、寧遠將軍劉道規、龍驤將軍劉籓、振威將軍檀憑之等，忠烈斷金，精貫白日，荷戈奮袂，誌在畢命。益州刺史毛璩，萬裏齊契，掃定荊楚。江州刺史郭昶之，奉迎主上，宮於尋陽。鎮北參軍王元德等，並率部曲，保據石頭。揚武將軍諸葛長民，收集義士，已據曆陽。征虜參軍庾賾之等，潛相連結，以為內應。同力協規，所在蜂起，即日斬偽徐州刺史安城王修、青州刺史弘首。義眾既集，文武爭先，鹹謂不有一統，則事無以輯。諱辭不獲已，遂總軍要。庶上憑祖宗之靈，下罄義夫之力，翦馘逋逆，蕩清京輦。公侯諸君，或世樹忠貞，或身荷爵寵，而並俯眉猾豎，自效莫由，顧瞻周道，寧不吊乎！今日之舉，良其會也。諱以虛薄，才非古人，接勢於已替之機，受任於既頹之運。丹誠未宣，感慨憤躍，望霄漢以永懷，眄山川以增厲。授檄之日，神馳賊廷。
裏邀的哥哥劉逼原先在京城，事情發動前幾天，高祖派遣同謀的人周安穆告訴他，讓他做內應。劉邁外表上雖然許諾，內心很害怕。安穆見他惶恐，顧慮事情必會泄露，就飛奔返回。當時桓玄任命劉邁為競陵太守，劉邁不知該怎麼做，就上船想到郡中。這天夜間，桓玄給劉邁寫信說：“比府人心如何?你近來見到劉裕講了些什麼?”劉邁以為桓玄已經知道了密謀，早晨起來便去報告。桓玄震驚畏懼，封劉遇為重安侯；不久嫌劉逋沒有捉住安穆，使安穆得以逃走，就殺丁劉邁。誅殺元德、扈興、厚之等人。召桓謙、卞範之等人謀劃抗拒高祖。桓謙等人說：“馬上派兵攻打他們。”桓玄說：“不能這樣。他們的兵士行動快，不怕死．如果派遣水軍，不足以抗衡，假使有閃失，則他們的氣勢形成而我們的事情就失敗了。不如在覆舟山駐紮大軍來等待他們。他們憑空行走二百裏，沒有動手，銳氣已受挫，到達之後，忽然遇見大軍。必定驚恐。我們屯兵不動加固陣勢，不同他們交鋒，他們尋求作戰而不能達到，自然四散逃跑。這是上等的計策。”桓謙等人堅決請求，才派遣頓丘太守吳甫之、右衛將軍皇甫敷向北抗拒起義軍。

以孟昶為長史，總攝後事；檀憑之為司馬。百姓願從者千餘人。三月戊午朔，遇吳甫之於江乘。甫之，玄驍將也，其兵甚銳。高祖躬執長刀，大呼以衝之，眾皆披靡，即斬甫之。進至羅落橋，皇甫敷率數千人逆戰。寧遠將軍檀憑之與高祖各禦一隊，憑之戰敗見殺，其眾退散。高祖進戰彌厲，前後奮擊，應時摧破，即斬敷首。初，高祖與何無忌等共建大謀，有善相者相高祖及無忌等並當大貴，其應甚近，惟雲憑之無相。高祖與無忌密相謂曰：“吾等既為同舟，理無偏異。吾徒鹹皆富貴，則檀不應獨殊。”深不解相者之言。至是而憑之戰死，高祖知其事必捷。
桓玄自從聽說軍隊起事，就憂慮恐懼不知如何是好．有人說：“劉裕等人兵力很小，哪能起事成功，陛下何必如此擔憂?”桓玄說：“劉裕足以成為一代的英雄；劉毅家無擔石存糧，賭博卻一擲百萬；坦叁晝是劉生之的外甥，很像他的舅父。共舉大事，哪裹能說不能成功?”

玄聞敷等並沒，愈懼，使桓謙屯東陵口，卞範之屯覆舟山西，眾合二萬。己未旦，義軍食畢，棄其餘糧，進至覆舟山東，使丐士張旗幟於山上，以為疑兵；玄又遣武騎將軍庾禕之，配以精卒利器，助謙等。高祖躬先士卒以奔之，將士皆殊死戰，無不一當百，呼聲動天地。時東北風急，因命縱火，煙焰張天，鼓噪之音震京邑。謙等諸軍，一時土崩。玄始雖遣軍置陣，而走意已決，別使領軍將軍殷仲文具舟於石頭，仍將子侄浮江南走。庚申，高祖鎮石頭城，立留台，總百官，焚桓溫神主於宣陽門外，造晉新主，立於太廟。遣諸將帥追玄，尚書王嘏率百官奉迎乘輿。司徒王謐與眾議推高祖領揚州，固辭。乃以謐為錄尚書事，領揚州刺史。於是推高祖為使持節、都督揚徐兗豫青冀幽並八州諸軍事、領軍將軍、徐州刺史。
眾人推舉宜砠為盟主，向京城發布文告，說：治亂交替出現，沒有永久的太平，賊寇作亂，往往發生在太平之時。自我大晉，厄運屢次出現，隆安年間以來，禍難連結於皂室，忠臣死在虎口中，良亡死在豺狼之手。叛臣駐欺淩人鬼，擁兵於荊州郢州，在京城恣意暴虐。上天沒有除去禍難，凶黨繁茂興盛，一年之間就傾覆皇位。主上流亡．到了非人生活之處，帝位陷落，七廟毀滅。題有鯉、墮，選有妓、壟，和但玄相比，還嫌不足。自從桓玄篡位，到現在已經一年，天早連年，民眾沒有生機。加上官吏民眾為運輸而疲勞，文官武將為建築而受困，父子分離，家庭四散，豈衹是《大東》有婦女的悲傷，《標梅》有盡其所有的征收啊?仰觀天體運行，俯家人間事務，這如果能長久，誰還會滅亡?凡是有良心的人，誰不惋惜?這是劉裕等人所以痛苦之極，不能安居的原因。所以晚睡早起，表彰忠良，聚於崎嶇道路，危險超過踐踏虎尾。輔國將軍劉毅、廣武將軍何無忌、鎮北主簿孟昶、兗州主簿魏詠之、寧遠將軍劉道規、龍驤將軍劉藩、振威將軍檀憑之等人，其忠烈可以斷金，其精誠可貫曰月，手執兵器奮起，決心為國捐軀。益州刺史毛璩，萬裏同心，掃蕩荊楚。江州刺史郭昶之，迎接主上，在尋陽建立宮室。鎮北參軍王元德等人，都率領部屬，據守石頭。揚武將軍諸葛旦匡，招集正義之士，已經占據曆陽。征虜參軍庾跡之等人，暗中集結，作為內應。同心協力，各地蜂擁而起，當日斬偽徐州刺史室蟈王但籃、壹業刺史旦弘的首級。起義兵眾集合後，文武官員奮勇爭先。都認為沒有統一調度，事情就不能成功。劉裕迫不得已，總領軍中要務．希望上憑祖宗的威靈。下盡義士的力量，剪除叛逆，肅清京城。

先是，朝廷承晉氏亂政，百司縱弛，桓玄雖欲厘整，而眾莫從之。高祖以身範物，先以威禁內外，百官皆肅然奉職。二三日間，風俗頓改。且桓玄雖以雄豪見推，而一朝便有極位，晉氏四方牧守及在朝大臣，盡心伏事，臣主之分定矣。高祖位微於朝，眾無一旅，奮臂草萊之中，倡大義以複皇祚。由是王謐等諸人時眾民望，莫不愧而憚焉。
公侯諸君，有的世代忠貞，有的身受爵寵，卻都向狡猾的小人低頭，效命無路，觀望周伐大道，難道不悲傷嗎?現在起事，實在正是機會。劉裕德行薄弱，才能不及古人，獲掌已經踐履的樞要，受任於國運衰頹之時。赤誠的心沒有表達，感慨激憤，望雲霄而詠歎，望山川而增添鬥誌。發布檄文的時候，心思已奔向賊寇的朝廷。

諸葛長民失期不得發，刁逵執送之，未至而玄敗。玄經尋陽，江州刺史郭昶之備乘輿法物資之。玄收略得二千餘人，挾天子走江陵。冠軍將軍劉毅、輔國將軍何無忌、振武將軍劉道規率諸軍追討。尚書左仆射王愉、愉子荊州刺史綏等，江左冠族。綏少有重名，以高祖起自布衣，甚相淩忽。綏，桓氏甥，亦有自疑之誌。高祖悉誅之。四月，奉武陵王遵為大將軍，承製，大赦天下，唯桓玄一祖後不在赦例。
任命逼趙為長史，總領後方事務；檀憑之擔任司馬．百姓願意跟從的有一千多人．

初，高祖家貧，嚐負刁逵社錢三萬，經時無以還。逵執錄甚嚴，王謐造逵見之，密以錢代還，由是得釋。高祖名微位薄，盛流皆不與相知，唯謐交焉。桓玄將篡，謐手解安帝璽紱，為玄佐命功臣。及義旗建，眾並謂謐宜誅，唯高祖保持之。劉毅嚐因朝會，問謐璽紱所在，謐益懼。及王愉父子誅，謐從弟諶謂謐曰：“王駒無罪，而義旗誅之，此是剪除勝己，以絕民望。兄既桓氏黨附，名位如此，欲求免得乎？”駒，愉小字也。謐懼，奔於曲阿。高祖箋白大將軍，深相保謐，迎還複位。光祿勳丁承之、左衛將軍褚粲、遊擊將軍司馬秀役使官人，為禦史中丞王禎之所糾察，謝箋言辭怨忿。承之造司宜藏。高祖與大將軍箋，白“粲等備位大臣，所懷必盡，執憲不允，自應據理陳訴，而橫興怨忿，歸咎有司，宜加裁當，以清風軌”。並免官。
三月戊午初一，在江乘遭遇吳甫之。甫之，是桓玄驍勇的將領，士卒精銳。高祖親自手執長刀，大聲呼喊著衝擊他們，甫之的部眾都望風披靡，當即斬殺甫之。進軍到羅落橋，皇甫敷率領幾千人迎戰。寧遠將軍檀憑之和高祖各率一隊人馬，憑之戰敗而死，他的部下逃散。高祖上前交戰越發勇猛，前後衝擊，很快打敗桓玄的軍隊，當即斬下皇甫敷的首級。當初高祖和何無忌等人共同確立大計，有善於看相的人看高祖和無忌等人都會大貴，應驗很切近，惟獨說憑之沒有富貴相。高祖和無忌互相秘密地說：“我們既是同舟共濟，道理上不能大有差異。我們都當富貴，那麼檀憑之不應獨自不同。”很不理解看相者的話。到逭時憑之戰死，高祖知道事情必定成功。

桓玄兒子韶，聚眾向曆陽，高祖命輔國將軍諸葛長民擊走之。無忌、道規破玄大將郭鈐等於桑落洲，眾軍進據尋陽。加高祖督江州諸軍事。玄既還荊郢，大聚兵眾，召水軍造樓船、器械，率眾二萬，挾天子發江陵，浮江東下，與冠軍將軍劉殷等相遇於崢嶸洲，眾軍下擊，大破之。玄棄眾，複挾天子還複江陵。玄黨殷仲文奉晉二皇後還京師。玄至江陵，因西走。南郡太守王騰之、荊州別駕王康產奉天子入南郡府。初，征虜將軍、益州刺史毛璩，遣從孫祐之與參軍費恬送弟喪下，有眾二百。璩弟子修之時為玄屯騎校尉，誘玄以入蜀。至枚回洲，恬與祐之迎射之。益州督護馮遷斬玄首，傳京師，又斬玄子升於江陵市。
桓玄聽說皇甫敷等人戰死，更加畏懼。派桓謙駐守東陵口，卞範之駐守覆舟山西麵，部眾共二萬人、、己未早晨，起義軍進餐完翠，拋棄剩餘的糧食，推進到覆舟山東麵，派乞丐在山上豎起旗幟，作為疑兵。桓玄又派遣武騎將軍庾幃之，配備精銳的兵士鋒利的兵器，協助桓謙等人。高擔身先士卒衝擊他們，將領士兵都拚死作戰，無不以一當百，呼喊聲震動天地。當時東北風猛烈，高祖因而下令放火，煙火衝天，鼓噪的聲音震撼京城．桓謙等各軍，一時之間上崩瓦解。桓玄開始雖然派兵布陣，而逃走的主意已定，另外派遣領軍將軍殷仲文在石頭城準備船隻，隨即帶領子侄渡江向南逃跑。

初，玄敗於崢嶸洲，義軍以為大事已定，追躡不速。玄死幾一旬，眾軍猶不至。玄從子振逃於華容之湧中，招聚逆黨數千人，晨襲江陵城，居民競出赴之。騰之、康產皆被殺。桓謙先匿於沮川，亦聚眾以應。振為玄舉哀，立喪廷。謙率眾官奉璽綬於安帝。無忌、道規既至江陵，與桓振戰於靈溪。玄黨馮該又設伏於楊林，義軍奔敗，退還尋陽。兗州刺史辛禺懷貳。會北青州刺史劉該反，禺求征該，次淮陰，又反。禺長史羊穆之斬禺，傳首京師。十月，高祖領青州刺史。甲仗百人入殿。
庚申，高祖鎮守石頭城，確立留台官員，在宣陽門外燒了桓溫的牌位，造晉國的新牌位立在太廟中?派遣將帥追擊桓玄，尚書王嘏率領百官迎接皇帝。司徒王謐和眾人商議推舉高祖兼任揚州刺史，宣擔堅決推辭．於是任用王謐為錄尚書事，兼撾州刺史。這時推舉高祖為使持節、都督擾強查逸直冀幽甚八州諸軍事、領軍將軍、徐州刺史：此前朝廷繼承晉氏的混亂政局，百官放縱，但直雖想整頓，而眾人不從。高祖以身作則，威鎮內外官員，百官都嚴肅地履行職責，二三口之間，風俗大變。而且桓玄雖然足以英雄豪傑受到推舉。而一旦擁有帝位，置壓四方的刺史郡守和在朝的大臣，都盡心侍奉，君臣的名分確定了．產擔在朝中地位低，部屬不足五百人，起自民間，倡導大義恢複皇位。因此玉遙等各人這時失去民心，無不慚愧而畏懼。

劉毅諸軍複進至夏口。毅攻魯城，道規攻偃月壘，皆拔之。十二月，諸軍進平巴陵。義熙元年正月，毅等至江津，破桓謙、桓振，江陵平。天子反正。三月，天子至自江陵。詔曰：
諸葛長民延誤時間未能發動，刁逵捉住他押送入京，沒有到京城而桓玄已敗。

古稱大者天地，其次君臣，所以列貫三辰，神人代序，諒理本於造昧，而運周於萬葉。故盈否時襲，四靈通其變；王道或昧，貞賢拯其危。天命所以永固，人心所以攸穆。雖夏、周中傾，賴靡、申之績，莽、倫載竊，實二代是維，或乘資藉號，或業隆異世，猶詩書以之休詠，記策用為美談。未有因心撫民，而誠發理應，援神器於已淪，若在今之盛者也。朕以寡昧，遭家不造，越自遘閔，屬當屯極。逆臣桓玄，乘釁縱慝，窮凶恣虐，滔天猾夏。遂誣罔人神，肆其篡亂。祖宗之基既湮，七廟之饗胥殄，若墜淵穀，未足斯譬。
桓玄經過尋陽，江州刺史郭昶之備齊皇帝車輛器物資助他。桓玄招募二千多人，挾持天於逃到江陵。冠軍將軍劉毅、輔國將軍何無忌、振武將軍劉道規率領各軍追擊討伐。

皇度有晉，天縱英哲，使持節、都督揚徐兗豫青冀幽並江九州諸軍事、鎮軍將軍、徐青二州刺史，忠誠天亮，神武命世，用能貞明協契，義夫響臻。故順聲一唱，二溟卷波；英風振路，宸居清翳。暨冠軍將軍毅、輔國將軍無忌、振武將軍道規，舟旗遄邁，而元凶傳首；回戈疊揮，則荊、漢霧廓。俾宣、元之祚，永固於嵩、岱；傾基重造，再集於朕躬。宗廟歆七百之祜，皇基融載新之命。念功惟德，永言銘懷。固已道冠開辟，獨絕終古，書契以來，未之前聞矣。雖則功高靡尚，理至難文，而崇庸命德，哲王攸先者，將以弘道製治，深關盛衰。故伊、望膺殊命之錫，桓、文饗備物之禮，況宏征不世，顧邈百代者，宜極名器之隆，以光大國之盛。而鎮軍謙虛自衷，誠旨屢顯。朕重逆仲父，乃所以愈彰德美也。鎮軍可進位侍中、車騎將軍、都督中外諸軍事，使持節、徐青二州刺史如故。顯祚大邦，啟茲疆宇。
尚書左仆射王愉、王愉的兒子荊州刺史王綏等人，是江左的名門望族。王綏年輕時有大名聲，因壺擔出自於平民，很輕視他。王綏，是桓壓的外甥，也有自我疑慮的心思。高祖全部殺了他們。

高祖固讓；加錄尚書事，又不受，屢請歸籓。天子不許，遣百僚敦勸，又親幸公第。高祖惶懼，詣闕陳請，天子不能奪。是月，旋鎮丹徒。天子重遣大使敦勸，又不受。乃改授都督荊、司、梁、益、寧、雍、涼七州，並前十六州諸軍事，本官如故。於是受命解青州，加領兗州刺史。
四月，奉武陵王司馬遵為大將軍，秉承皇帝之命便宜行事。大赦天下，衹有與桓玄同祖者例外。

盧循浮海破廣州，獲刺史吳隱之。即以循為廣州刺史，以其同黨徐道覆為始興相。二年三月，督交、廣二州。十月，高祖上言曰：“昔天禍皇室，巨狡縱篡，臣等義惟舊隸，豫蒙國恩，仰契信順之符，俯厲人臣之憤，雖社稷之靈，抑亦事由眾濟。其翼獎忠勤之佐，文武畢力之士，敷執在己之謙，用虧國體之大，輒申攝眾軍先上，同謀起義，始平京口、廣陵二城。臣及撫軍將軍毅等二百七十二人，並後赴義出都，緣道大戰，所餘一千五百六十六人。又輔國將軍長民、故給事中王元德等十人，各一千八百四十八人，乞正封賞。其西征眾軍，須論集續上。”於是尚書奏封唱義謀主鎮軍將軍諱豫章郡公，食邑萬戶，賜絹三萬匹。其餘封賞各有差。鎮軍府佐吏，降故太傅謝安府一等。十一月，天子重申前令，加高祖侍中，進號車騎將軍、開府儀同三司。固讓。詔遣百僚敦勸。三年二月，高祖還京師，將詣廷尉；天子先詔獄官不得受，詣闕陳讓，乃見聽。旋於丹徒。
當初壺趄家中貧窮，曾經欠刁逵的社錢三萬，長時間不還。衛達捉住他逼債，王謐造訪刁逵時見到這件事，暗中代還丁錢，高祖因此得釋。直擔名聲小地位低，名流都不同他相交往，惟獨王譴同他交往。桓玄將要篡位，王謐親手解下圭壺的玉璽絲帶，成為桓玄的輔佐功臣。等到起義旌旗樹起，眾人都說王謐應該誅殺，惟有高擔保護他。型塑曾利用朝廷集會，詢問王謐玉璽絲帶在何處，王壟更加害怕。等到王愉父子被殺，王謐的堂弟王諶對玉錘說：“王鮑沒有罪過，而起義軍殺了他，這是鏟鋤超過自己的人，來斷絕民眾的希望。兄長既是桓氏黨羽，名聲地位如此高，想求免死能達到嗎?”王駒是王愉的小名．：王壟畏懼，逃到迪阿。直擔上書大將軍，極力保護王謐，迎接他官複原職。光祿勳卞承之、左衛將軍撞塞、遊擊將軍]壁晝役使官府人員，被禦史中丞王禎之糾察，道歉的文書中言辭充滿怨恨憤怒．丞之到司宜藏。高祖給大將軍送呈文書，稟報“褚粲等人處於大臣之位，想法必合情理。別人執法不公，自應據理陳述，然而卻心懷怨恨，把過錯歸到有關部門。對此應加以製裁，以明法度”。把褚粲等人都免除宮職。

閏月，府將駱冰謀作亂，將被執，單騎走，追斬之。誅冰父永嘉太守球。球本東陽郡史，孫恩之亂，起義於長山，故見擢用。初，桓玄之敗，以桓衝忠貞，署其孫胤。至是冰謀以胤為主，與東陽太守殷仲文潛相連結。乃誅仲文及仲文二弟。凡桓玄餘黨，至是皆誅夷。
桓玄哥哥的兒子桓歆，聚眾向曆陽進發，高祖命令輔國將軍諸葛長民出擊打退了他。無忌、道規在桑落洲打敗桓玄的大將郭銓等人，各軍前進占據尋陽。加授高祖為都督江州諸軍事。桓玄回到塑業呈幽後，大量聚集兵馬，征召水軍製造戰船、器械，率領軍隊二萬人，挾持天子從江墮出發，從晝遼東下，同冠軍將軍劉毅等人在崢噬洲相遇，各軍下船出擊，大敗桓玄。桓玄拋下部眾，又挾持天子返回江陵。桓玄的同黨殷仲文侍奉置魚二位皇後回到京城。桓玄到達江陵，隨即向西逃跑。南郡太守王騰之、荊州別駕王康產侍奉天子進入南郡官府。起初征虜將軍、益州刺史王壁，派遣堂孫違之和參軍費垣護送弟弟的霞柩束下，有兵士二百人。毛璩弟弟的兒子脩之當時任旦玄的屯騎校尉，誘騙但玄入蜀。到達枚回泌，壹區和違之迎上前射擊桓玄。益州督護馮遷斬下旦玄的首級送到京城。又在江陵街市斬殺桓宣的兒子但晝。

天子遣兼太常葛籍授公策曰：“有扈滔天，夷羿乘釁，亂節幹紀，實撓皇極。賊臣桓玄，怙寵肆逆，乃摧傾華、霍，倒拔嵩、岱，五嶽既夷，六地易所。公命世英縱，藏器待時，因心資敬，誓雪國恥。慨憤陵夷，誠發宵寐。既而歲月屢遷，神器已遠，忠孝幽寄，實貫三靈。爾乃介石勝機，宣契畢舉，訴蒼天以為正，揮義旅而一驅；奔鋒數百，勢烈激電，百萬不能抗限，製路日直植城。遂使衝鯨潰流，暴鱗奔漢，廟勝遠加，重氛載滌，二儀廓清，三光反照，事遂永代，功高開辟，理微稱謂，義感朕心。若夫道為身濟，猶縻厥爵，況乃誠德俱深，勳冠天人者乎！是用建茲邦國，永祚山河，言念載懷，匪雲足報。往欽哉！俾屏餘一人，長弼皇晉，流風垂祚，暉烈無窮。其降承嘉策，對揚朕命。”十二月，司徒、錄尚書、揚州刺史王謐薨。
當初擔玄在峻哩迦失敗，起義軍以為大事已定，追擊不力．但玄死後將近十天，各軍還沒到。擔玄的侄兒擔麵逃到楚容的通主，招集叛黨幾千人，清晨襲擊江陵城，居民競相出城投奔他。躂之、屋產都被殺害。桓謎原先躲藏在沮貝，也聚集部眾來響應．桓振為桓玄發喪，設立治喪場所。逗諶率領眾官員把玉璽絲帶獻給安壺。翅晝、道趄到達毖後，同旦麵在靈選交戰。但玄的黨羽邁譴在擾撻設下埋伏，起義軍失敗逃奔，退回尋陽。

四年正月，征公入輔，授侍中、車騎將軍、開府儀同三司、揚州刺史、錄尚書、徐兗二州刺史如故。表解兗州。先是，遣冠軍劉敬宣伐蜀賊譙縱，無功而返。九月，以敬宣挫退，遜位，不許。乃降為中軍將軍，開府如故。
查州刺史圭墾有二心。遇北青州刺史劉該反叛，主星請求征討劉茵，停駐在淮陰，又反叛。芒星的長史羊穆之斬殺芝雖，傳送首級到京城。十月，壺擔兼任壹州刺史。率儀仗一百人進殿。

初，偽燕王鮮卑慕容德僭號於青州，德死，兄子超襲位，前後數為邊患。五年二月，大掠淮北，執陽平太守劉千載、濟南太守趙元，驅略千餘家。三月，公抗表北討，以丹陽尹孟昶監中軍留府事。四月，舟師發京都，溯淮入泗。五月，至下邳，留船艦輜重，步軍進琅邪；所過皆築城留守。鮮卑梁父、莒城二戍並奔走。慕容超聞王師將至，其大將公孫五樓說超：“宜斷據大峴，刈除粟苗，堅壁清野以待之。彼僑軍無資，求戰不得，旬月之間，折棰以笞之耳。”超不從，曰：“彼遠來疲勞，勢不能久；但當引令過峴，我以鐵騎踐之，不憂不破也。豈有預芟苗稼，先自蹙弱邪！”初，公將行，議者以為賊聞大軍遠出，必不敢戰。若不斷大峴，當堅守廣固，刈粟清野，以絕三軍之資，非唯難以有功，將不能自反。公曰：“我揣之熟矣。鮮卑貪，不及遠計，進利克獲，退惜粟苗。謂我孤軍遠入，不能持久，不過進據臨朐，退守廣固。我一得入峴，則人無退心，驅必死之眾，向懷貳之虜，何憂不克！彼不能清野固守，為諸君保之。”公既入峴，舉手指天曰：“吾事濟矣！”
曲各軍又進軍駟。曲攻打鉍，齟攻打偃月壘，都攻下來了。十二月，各軍前進平定旦座。

六月，慕容超遣五樓及廣寧王賀賴盧先據臨朐城。既聞大軍至，留羸老守廣固，乃悉出。臨朐有巨蔑水，去城四十裏，超告五樓曰：“急往據之，晉軍得水，則難擊也。”五樓馳進。龍驤將軍孟龍符領騎居前，奔往爭之，五樓乃退。眾軍步進，有車四千兩，分車為兩翼，方軌徐行，車悉張幔，禦者執槊，又以輕騎為遊軍。軍令嚴肅，行伍齊整。未及臨朐數裏，賊鐵騎萬餘，前後交至。公命兗州刺史劉籓、弟並州刺史道憐、諮議參軍劉敬宣、陶延壽、參軍劉懷玉、慎仲道、索邈等，齊力擊之。日向昃，公遣諮議參軍檀韶直趨臨朐。韶率建威將軍向彌、參軍胡籓馳往，既日陷城，斬其牙旗，悉虜超輜重。超聞臨朐已拔，引眾走。公親鼓之，賊乃大破。超遁還廣固。獲超馬、偽輦、玉璽、豹尾等，送於京師；斬其大將段暉等十餘人，其餘斬獲千計。明日，大軍進廣固，既屠大城。超退保小城。於是設長圍守之，圍高三丈，外穿三重塹。停江、淮轉輸，館穀於齊土。撫納降附，華戎歡悅；援才授爵，因而任之。七月，詔加公北青、冀二州刺史。超大將垣遵、遵弟苗並率眾歸順。公方治攻具，城上人曰：“汝不得張綱，何能為也。”綱者，超偽尚書郎，其人有巧思。會超遣綱稱籓於姚興，乞師請救。興偽許之，而實憚公，不敢遣。綱從長安還，泰山太守申宣執送之。乃升綱於樓上，以示城內，城內莫不失色。於是使綱大治攻具。超求救不獲，綱反見虜，轉憂懼，乃請稱籓，求割大峴為界，獻馬千匹。不聽，圍之轉急。河北居民荷戈負糧至者，日以千數。
義熙元年正月，劉毅等人到達江津，打敗桓謙、桓振，江陵平定，天子重歸帝位。三月，天子從江陵歸來。下韶說：古人說首先是天地，其次是君臣，所以天上有曰月星辰，神入互相交替，道理起源於蒙昧時代，而行於萬代。所以滿虧相繼出現，四種靈物貫通其中變化，王道有時衰落，忠臣賢士拯救危難，天命因此不變，人心因此和順。雖然夏朝、周朝中途傾覆，依賴靡、申的功績，莽、倫竊位，維護二代。有的憑藉聲望依靠名號，有的業績隆盛於後世，《詩經》《尚書》因之歌詠，史冊傳為美談。沒有利用真心安撫民眾，而真誠發出循理響應，扶持帝位於已沉淪之時，如當今這樣強盛的。

錄事參軍劉穆之，有經略才具，公以為謀主，動止必諮焉。時姚興遣使告公雲：“慕容見與鄰好，又以窮告急，今當遣鐵騎十萬，徑據洛陽。晉軍若不退者，便當遣鐵騎長驅而進。”公呼興使答曰：“語汝姚興，我定燕之後，息甲三年，當平關、洛。今能自送，便可速來！”穆之聞有羌使，馳入，而公發遣已去。以興所言並答，具語穆之。穆之尤公曰：“常日事無大小，必賜與謀之。此宜善詳之，雲何卒爾便答？公所答興言，未能威敵，正足怒彼耳。若燕未可拔，羌救奄至，不審何以待之？”公笑曰：“此是兵機，非卿所解，故不語耳。夫兵貴神速，彼若審能遣救，必畏我知，寧容先遣信命。此是其見我伐燕，內已懷懼，自張之辭耳。”九月，進公太尉、中書監，固讓。偽徐州刺史段宏先奔索虜，十月，自河北歸順。
我以薄德弱才，遭遇家族不幸，父母之喪剛過，又遇時運艱難。叛臣桓玄，乘機恣意作惡，凶殘暴虐，罪惡滔天擾亂華夏。欺騙大眾神明，肆意篡位作亂。祖宗的基業埋沒，七廟的祭祀斷絕，猶如墜入深淵山穀，還不足以譬喻。

張綱治攻具成，設諸奇巧，飛樓木幔之屬，莫不畢備。城上火石弓矢，無所用之。六年二月丁亥，屠廣固。超逾城走，征虜賊曹喬胥獲之，殺其亡命以下，納口萬餘，馬二千匹。送超京師，斬於建康市。
維護晉朝，天縱英才，使持節、都督揚徐兗豫青冀幽並江九州諸軍事、鎮軍將軍、徐青二州刺史，忠誠如上天般明朗，神明英武著名於當代，以此能賢士協同，義士響應。所以歸順的聲音一發出，南海北海卷起波濤，英武的風暴震撼道路，京城肅清陰暗．及至冠軍將軍劉毅、輔國將軍無忌、振武將軍道規，戰船旌旗急進，而元凶的首級傳送，回師揮舞旌旗，荊山、漢水廓清。使宣帝、元帝的國運，如嵩山、岱山永遠堅固，傾覆的根基重新構造，再度集中於我身上。宗廟享受七百年的福祉，基業融入嶄新的天命。思念這些功勳德行，永遠銘記心中。本來已是道德高於開天辟地以來，超絕於千古，有文字記載以來，從前沒有聽說過。雖然功高無以複加，至理難以表述，而崇尚功勳褒揚德行，英明君主將其放在首的原因，當是用以弘揚道德控製政治，深切關涉到盛衰。所以伊尹、呂望受到特殊的賜予，齊桓公、晉文公享有完備的禮儀，何況宏大的征驗曠代難出，回顧百代難有匹敵的人呢。應該用盡名號器物的隆重，來昭明大國的盛典。然而鎮軍將軍謙虛發自內心，誠懇的心意屢次顯明，我難以違忤仲父，如此鎮軍將軍更顯得德行美好。鎮軍將軍可升任侍中、車騎將軍、都督中外諸軍事，使持節、途直二州刺史照舊。顯著賜予大國，開拓境土。

公之北伐也，徐道覆仍有窺窬之誌，勸盧循乘虛而出，循不從。道覆乃至番禺說循曰：“本住嶺外，豈以理極於此，正以劉公難與為敵故也。今方頓兵堅城之下，未有旋日。以此思歸死士，掩襲何、劉之徒，如反掌耳。不乘此機而保一日之安，若平齊之後，小息甲養眾，不過一二年間，必璽書征君。若劉公自率眾至豫章，遣銳師過嶺，雖複將軍神武，恐必不能當也。今日之機，萬不可失。既克都邑，傾其根本。劉公雖還，無能為也。”循從之，乃率眾過嶺。是月，寇南康、廬陵、豫章，諸郡守皆委任奔走。於時平齊問未至，既馳使征公。公之初克齊也，欲停鎮下邳，清蕩河、洛，既而被征使至，即日班師。
區型堅決推讓。加授綠尚書事，又不接受，屢次請求回到封地。天子不準，派百官勸告，又親自前往高祖宅第。高祖惶恐前往宮廷陳述，天子不改變他的主意。這個月，高祖返回鎮守丹矽。天子重新派遣大使勸說，高祖又不接受。於是改授為都督荊、司、梁、益、寧、雍、涼七州，加上從前為十六州諸軍事，原官照舊不變。這時壺擔受命解除直業刺史職位，另兼任兗州刺史。

鎮南將軍何無忌與徐道覆戰於豫章，敗績，無忌被害，內外震駭。朝廷欲奉乘輿北走就公，尋知賊定未至，人情小安。公至下邳，以船運輜重，自率精銳步歸。至山陽，聞無忌被害，則慮京邑失守，乃卷甲兼行，與數十人至淮上，問行旅以朝廷消息。人曰：“賊尚未至，劉公若還，便無所憂也。”公大喜，單船過江，徑至京口，眾乃大安。四月癸未，公至京師，解嚴息甲。
盧嫗從海上乘船攻下廣州，擒獲刺史吳隱之。當即任用盧循為盧州刺史，任用他的同黨徐道覆為始興相。

撫軍將軍劉毅抗表南征，公與毅書曰：“吾往習擊妖賊，曉其變態，新獲奸利，其鋒不可輕。宜須裝嚴畢，與弟同舉。”又遣毅從弟籓往止之。毅不從，舟師二萬，發自姑孰。循之初下也，使道覆向尋陽，自寇湘中諸郡。荊州刺史道規遣軍至長沙，為循所敗。徑至巴陵，將向江陵。道覆聞毅上，馳使報循曰：“毅兵眾甚盛，成敗事係之於此，宜並力摧之。若此克捷，天下無複事矣。根本既定，不憂上麵不平也。”循即日發巴陵，與道覆連旗而下。別有八艚艦九枚，起四層，高十二丈。公以南籓覆沒，表送章綬，詔不聽。五月，劉毅敗績於桑落洲，棄船步走，餘眾不得去者，皆為賊所擒。初，循至尋陽，聞公已還，不信也。既破毅，乃審凱入之問，並相視失色。循欲退還尋陽，進平江陵，據二州以抗朝廷。道覆謂宜乘勝徑進，固爭之。疑議多日，乃見從。
二年三月，都督交、廣二州。十月，高祖上疏說：“往昔上天降罪皇室，大奸賊篡位，臣下等人在道義上是舊臣屬，早蒙國家恩典，上契合誠信歸附的符命，下激勵臣子的義憤，雖然是國家的福分，也是由眾人之力。應獎掖忠誠勤奮的佐吏，盡力而為的文武之士，宣揚主上的謙恭，以免有損國家典章製度……現先行申報所統領各軍，共同謀劃發起義舉，開始平定京、廣陵二城，有臣下和撫軍將軍劉毅等二百七十二人．以及隨後奔赴大義到京城沿途大戰，上述人員外餘下的有一千五百六十六人，另有輔國將軍長屋、已故給事中王元德等十人，合計一千八百四十八人，請求正式封授賞賜。西征的各軍，待評定後陸續上報。”於是尚書上奏封倡導大義的主謀鎮軍將軍型塋為豫章郡公，食邑一萬戶，賜絹三萬匹。其餘封爵賞賜多少不等。鎮軍將軍府的佐吏，低於從前太傅謝安府一個等級．

毅敗問至，內外洶擾。於時北師始還，多創痍疾病。京師戰士，不盈數千。賊既破江、豫二鎮，戰士十餘萬，舟車百裏不絕。奔敗還者，並聲其雄盛。孟昶、諸葛長民懼寇漸逼，欲擁天子過江，公不聽，昶固請不止。公曰：“今重鎮外傾，強寇內逼，人情危駭，莫有固誌。若一旦遷動，便自瓦解土崩，江北亦豈可得至！設令得至，不過延日月耳。今兵士雖少，自足以一戰。若其克濟，則臣主同休；苟厄運必至，我當以死衛社稷，橫屍廟門，遂其由來以身許國之誌，不能遠竄於草間求活也。我既決矣，卿勿複言！”昶恐其不濟，乃為表曰：“臣諱北討，眾並不同，唯臣讚諱行計，致使強賊乘間，社稷危逼，臣之罪也。今謹引分以謝天下。”封表畢，乃仰藥而死。
十一月，天子重申前令，加授高祖為侍中，升為車騎將軍、開府儀同三司。高祖堅決推辭。天子詔令派遣百官勸說．

於是大開賞募，投身赴義者，一同登京城之科。發居民治石頭城，建牙戒嚴。時議者謂宜分兵守諸津要。公以為：“賊眾我寡，若分兵屯，則人測虛實。且一處失利，則沮三軍之心。今聚眾石頭，隨宜應赴，既令賊無以測多少，又於眾力不分。若徒旅轉集，徐更論之耳。”移屯石頭，乃柵淮斷查浦。既而群賊大至，公策之曰：“賊若於新亭直進，其鋒不可當，宜且回避，勝負之事，未可量也；若回泊西岸，此成擒耳。”
三年二月，高祖回到京城，將要前往廷尉，天子預先詔令獄官不予受理。高祖前往宮廷陳述，方得準許。高祖回到丹徒。

道覆欲自新亭、白石焚舟而上。循多疑少決，每欲以萬全為慮，謂道覆曰：“大軍未至，孟昶便望風自裁，大勢言之，自當計日潰亂。今決勝負於一朝，既非必定之道，且殺傷士卒，不如按兵待之。”公於時登石頭城以望循軍，初見引向新亭，公顧左右失色；既而回泊蔡洲。道覆猶欲上，循禁之。自是眾軍轉集，修治越城，築查浦、藥園、廷尉三壘，皆守以實眾。冠軍將軍劉敬宣屯北郊，輔國將軍孟懷玉屯丹陽郡西，建武將軍王仲德屯越城，廣武將軍劉默屯建陽門外。使寧朔將軍索邈領鮮卑具裝虎班突騎千餘匹，皆被練五色，自淮北至於新亭。賊並聚觀，鹹畏憚之；然猶冀京邑及三吳有應之者。遣十餘艦來拔石頭柵。公命神弩射之，發輒摧陷，循乃止，不複攻柵。設伏兵於南岸，使羸老悉乘舟艦向白石。公憂其從白石步上，乃率劉毅、諸葛長民北出拒之，留參軍徐赤特戍南岸，命堅守勿動。公既去，賊焚查浦步上，赤特軍戰敗，死沒有百餘人。赤特棄餘眾，單舸濟淮，賊遂率數萬屯丹陽郡。公率諸軍馳歸，眾憂賊過，鹹謂公當徑還拒戰，公先分軍還石頭，眾莫之曉。解甲息士，洗浴飲食之，乃出列陳於南塘。以赤特違處分，斬之。命參軍諸葛叔度、硃齡石率勁勇士千餘人過淮。群賊數千，皆長刀矛钅延，精甲曜日，奮躍爭進。齡石所領多鮮卑，善步槊，並結陳以待之。賊短兵弗能抗，死傷者數百人，乃退走。會日暮，眾亦歸。
閏月，府中將領駱冰作亂，將要被捉，單人匹馬逃跑，被追上斬殺。誅殺駱冰的父親永嘉太守豎球。駱球本來是東陽郡吏，孫恩之亂時，他在長山起義，所以被提拔。當初桓玄失敗，因桓衝忠誠堅貞，任用他的孫子桓胤。到這時駱冰圖謀以桓胤為君主，和東陽太守殷仲文暗中互相聯合。於是誅殺仲文和仲文的兩個弟弟．凡是桓玄的餘黨，至此全被殺掉．

劉毅之敗，豫州主簿袁興國反叛，據曆陽以應賊。琅邪內史魏順之遣將謝寶討斬之。興國司馬襲寶，順之不救而退，公怒斬之。順之，詠之之弟也。於是功臣震懾，莫敢不用命。六月，更授公太尉、中書監，加黃鉞。受黃鉞，餘固辭。以司馬庾悅為建威將軍、江州刺史，自東陽出豫章。七月庚申，群賊自蔡洲南走，還屯尋陽。遣輔國將軍王仲德、廣川太守劉鍾、河間太守蒯恩追之。公還東府，大治水軍，皆大艦重樓，高者十餘丈。盧循遣其大將荀林寇江陵，桓謙先於江陵奔羌，又自羌入蜀，偽主譙縱以為荊州刺史。謙及譙道福率軍二萬，出寇江陵，適與林會，相去百餘裏。荊州刺史道規斬謙於枝江，破林於江津，追至竹町，斬之。初，循之走也，公知其必寇江陵，登遣淮陵內史索邈領馬軍步道援荊州；又遣建威將軍孫季高率眾三千，自海道襲番禺。江州刺史庾悅至五畝嶠，賊遣千餘人據斷嶠道，悅前驅鄱陽太守虞丘進攻破之。公治兵大辦。十月，率兗州刺史劉籓、寧朔將軍檀韶等舟師南伐。以後將軍劉毅監太尉留守府，後事皆委焉。是月，徐道覆率眾三萬寇江陵。荊州刺史道規又大破之，斬首萬餘級，道覆走還盆口。初，公之遣索邈也，邈在道為賊所斷，道覆敗後方達。自循東下，江陵斷絕京邑之問，傳者皆雲已沒。及邈至，方知循走。
天子派遣兼太常葛籍授予豫章郡公策書說：“直塵罪惡滔天，裹翌乘機作亂，擾亂節度幹犯法紀，削弱王室。賊臣桓玄，恃寵叛逆，摧垮華山、霍山，倒拔嵩山、泰山，鏟平五嶽，天地四方改變。公才華蓋世天賦英武，懷才等待時機，發自內，誓洗國家恥辱，憤慨衰微，日夜抒發誠意。不久歲月流逝，帝位失去多時，心懷忠孝暗中寄托，溝通天地人。不改節操遏製凶殘，倡導者和響應者一同起事，向蒼天申訴正道，指揮起義軍而驅馳。前鋒幾百人，勢如閃電，百萬人馬不能抗衡，奪路逼近京城。於是使大惡之人潰敗，暴死於晝紅蓮丞中，謀略遙遠地發出，濃密的凶氣被蕩滌，天地澄清，日月星辰照耀，事跡傳揚千古，功高於古今，道理上難以述說，大義感動我的心。為救濟自身而實行道義，還受到封爵，何況是誠意德行都深厚，功勳高於天人呢?因而建立邦國，山河水固，此言出自肺腑，何足為報。努力吧保障我一人，永久保佑晉朝，流傳後世，傳諸永久。可抑製心誌接受美好的策封，應答我的詔命。”

循初自蔡洲南走，留其親黨範崇民五千人，高艦百餘，戍南陵。王仲德等聞大軍且至，乃進攻之。十一月，大破崇民軍，焚其舟艦，收其散卒。循廣州守兵，不以海道為防。是月，建威將軍孫季高乘海奄至，而城池峻整，兵猶數千。季高焚賊舟艦，悉力而上，四麵攻之，即日屠其城。循父以輕舟奔始興。季高撫其舊民，戮其親黨，勒兵謹守。初，公之遣季高也，眾鹹以海道艱遠，必至為難；且分撤見力，二三非要。公不從。敕季高曰：“大軍十二月之交，必破妖虜。卿今時當至廣州，傾其巢窟，令賊奔走之日，無所歸投。”季高受命而行，如期克捷。
十二月，司徒、綠尚書事、揚州刺史王謐逝世。

循方治兵旅舟艦，設諸攻備。公欲禦以長算，乃屯軍雷池。賊揚聲不攻雷池，當乘流徑下。公知其欲戰，且慮賊戰敗，或於京江入海，遣王仲德以水艦二百於吉陽下斷之。十二月，循、道覆率眾數萬，方艦而下，前後相抗，莫見舳艫之際。公悉出輕利鬥艦，躬提幡鼓，命眾軍齊力擊之；又上步騎於西岸。右軍參軍庾樂生乘艦不進，斬而徇之，於是眾軍並踴騰爭先。軍中多萬鈞神弩，所至莫不摧陷。公中流蹙之，因風水之勢，賊艦悉泊西岸，上軍先備火具，乃投火焚之。煙焰張天，賊眾大敗，追奔至夜乃歸。循等還尋陽。初分遣步軍，莫不疑怪，及燒賊艦，眾乃悅服。召王仲德，請還為前驅，留輔國將軍孟懷玉守雷池。循聞有大軍上，欲走向豫章，乃悉力柵斷左裏。大軍至左裏，將戰，公所執麾竿折，折幡沈水，眾並怪懼。公歡笑曰：“往年覆舟之戰，幡竿亦折；今